此次《預算法》修正案(草案)擬刪除現行預算法中關于“中央國庫業務由中國人民銀行經理”的規定，并增加“國庫管理的具體辦法由國務院規定”的表述。

中央財經大學財經研究院院長王雍君曾在接受媒體采訪時稱，經理制意味著人民銀行國庫是對政府負責，政府與央行之間存在委托關系。代理制下，人民銀行國庫向財政部門負責，財政部門委托銀行來管理國庫。“經理制下，央行經理國庫的職責非常大，而代理制下央行就會處處受制于財政部門。”

中央財經大學中國銀行業研究中心主任郭田勇認為，從“經理”到“代理”并沒有什么本質的差別，以前央行一方面需要做好資金的出納工作，同時需要做好資金管理工作，現在由于財政部成立國庫局，使得央行的經理國庫的職能弱化，在出納這方面的作用比較突出，這種職能的轉變可以使央行的工作比較超然。同時財政每天資金出入比較大，如果通過央行的話，效率會比較低。

他還表示，財政部的職能在加強，因此總體上來講在監督上并沒有多少弱化，相反，如果每一筆錢都去監督的話，反而效率低，成本也會比較高。

銀河證券首席經濟學家左小蕾表示，國庫由央行經理的話，會導致效率比較低，這也是需要改革的原因。改由央行代理會增加撥款的效率，提高對突發事件的應對速度。國外因為和國內體制等方面的差異，因此并不具有可比性。“這次弱化央行在國庫管理體制中的地位，強化了財政部門的作用，必然會導致對預算的監督弱化，這方面就需要在改革的基礎上，增加其他方面對預算的監督，否則容易出問題”。左小蕾說